Trận tranh Siêu Cúp QG 2019 diễn ra trên sân Thống Nhất chiều 1/3, trung vệ Duy Mạnh trong một pha tranh chấp bóng với tiền đạo đối phương đã gặp phải chấn thương và phải rời sân từ phút 6. 

Chấn thương của Duy Mạnh khiến cho nhiều người lo lắng. Sau trận đấu, HLV Chu Đình Nghiêm tiết lộ: "Duy Mạnh có chia sẻ rằng anh ta bị vặn đầu gối. Tuy nhiên, chúng tôi cần kiểm tra thêm để biết rõ thông tin. Đây chắc chắn là một chấn thương nặng. Duy Mạnh đang rất đau và chưa thể đi lại bình thường. Tôi hy vọng đầu gối không bị tràn dịch để có thể đi chụp phim ngay. Nhưng nếu tràn dịch thì chúng tôi phải đợi cho hết dịch".

Dù vắng cả hai trụ cột nơi hàng thủ là Duy Mạnh và Đình Trọng nhưng Hà Nội FC đã có một màn trình diễn xuất sắc để lội ngược dòng với tỉ số 2-1 trước CLB TP. HCM, qua đó giành danh hiệu đầu tiên của mùa giải mới. Duy Mạnh đã phải nhờ một bác sĩ của Hà Nội FC cõng lên bục nhận huy chương.

Việc Duy Mạnh dính chấn thương là một tổn thất rất lớn đối với hàng thủ của Hà Nội FC lẫn ĐT Việt Nam trong thời gian tới. Sự thiếu vắng cả Duy Mạnh và Đình Trọng (treo giò) chắc chắn khiến cho HLV Park Hang-seo đau đầu về nhận sự chuẩn bị cho trận làm khách trước Malaysia tại Vòng loại World Cup 2022.